カード配置の基本は、『いかにダメージを受けないか』と 『配置が変わった時にどう動くか』の２点です。
攻撃を受ける確率はカードを置く場所によって異ななるため、どこにどのカードを配置するかが重要になってきます。
前列は、相手のデッキと接近していることが多いので攻撃する機会もされる機会も多くなります。 そのため、攻撃力とHPが高いカードを設置するとよいでしょう。
中列は、作戦によって置くカードの特徴が異なります。前列に置いたカードの攻撃力を活かす作戦であれば、 前列のカードのATをアップさせたり、HPを回復する行動を持つカードを置くとよいでしょう。
中列からも積極的に攻撃をする作戦であれば、ATの高いカードを置くとよいでしょう。もちろん、前列に移動した場合のことも忘れずに。
後列は、攻撃を受ける機会は前列、中列に比べて少ないため生き残る確率が高いです。そのため、前のカードが戦闘不能になり、中列、前列へ移動した場合を想定して選ぶことがポイントです。

スカイガレオンにおいては絶対最強のデッキはありません。コスト制限や所持カードに余裕が出てきたら、自分なりに方向性を決めてデッキを構築してみましょう。
たとえば、AT・AGを上昇させるスキルを持つカードを組み合わせ、すべてのカードで攻撃を仕掛けて敵を薙ぎ払ったり、特技が強力なカードと特技ゲージを減少させる能力（威光）を持つカードを組み合わせ、早いターンで特技を発動させて敵を制圧するなど、戦略は数多く存在するので、色々試してみましょう。

カードの通常行動（スキル）や特技は、前列では攻撃だが中列ではATを上昇させたりHPを回復したりなどのサポート系のスキルといった具合に、配置によって大きく変わる場合があります。
デッキを組んだ後はテストバトルなどを行い、想定通りの動きをしているかどうかプレビューを見てチェックしてみましょう。
また、作戦によって特徴が異なりますが、行動するまでにターン数が必要な特技が強力なカードや、前列・中列をサポートするカードを置くのも良いでしょう。

デッキの必殺技には味方を回復・蘇生したり、敵にダメージを与えるものなど様々な種類があり、特定の条件をクリアすることで更にパターンが増えていきます。
指定したターンに発動され、これによって戦局が大きく変わることもあるので、デッキに適した必殺技を設定しておきましょう。